Dynamische biochemie

17-06-17 

1) Allosterie en cooperativiteit hemoglobine

2) Afbraak vertakt vetzuur

3) N-Flow afbraak aminozuren, wat met koolstofskelet?

4)

- Tripeptide

- ribunocleotidereductase

- katalytische efficiëntie

- Afbeelding Ramachandran plot

17-06-16

1) Synthese cholesterol, hoe wordt het vervoerd in het lichaam (figuur), en hoe wordt het gereguleerd (schema)(mondeling)

2) Bespreek glucogene en ketogene az'en, en geef voorbeelden, wat is hun fysiologisch belang

3) bespreek allosterie en coöperativiteit bij hemoglobine

4) verduidelijk:(mondeling)

• HECC, pH=7, O2

• Thymidilaat synthase

• carnitine shuttle
• afbeelding van ATP synthase

10/06/16

- bespreek allosterie en cooperativiteit aan de hand van hemoglobine en O2 transport (modeling)

- leg schematisch de B-oxidatie van een vertakt vetzuur uit

- geef schematisch het metabolsime van de hersenen in goed gevoede staat en bij vasten. Welke rol spelen lever en vetweefsel

- Bespreek (ook mondeling):

• tripeptide HIP bij pH 8
• ribunocleotidereductase
• katalytische effiecientie
• structuur van carbamoylfosfaat (een structuur uit de ureumcyclus)

23/06/15

- Bespreek via een schema de synthese en export van vetten in de lever

- Wat is het C1 metabolisme? Wat heeft dit te maken met de nucleotide synthese?

- reactie met enzyme gegeven, Km, kcat, concentratie substraat en enzyme zijn gegeven

a) wat is Vmax

b) wat is v

c) wat is de katalytische efficiëntie

d) bereikt het enzyme de katalytische perfectie?

- bespreek: tripeptide SIQ, transaminatie, PEPCK, tekening van anker vetzuren

12/06/15 VM

- Bespreek de enzymatische regulatie van glycogeenfosforylase en geef de fysiologische context (mondeling).

- Geef schematisch het metabolisme van de hersenen in goed gevoede staat en bij vasten. Welke rol spelen de lever en het vetweefsel? (schriftelijk)

- Geef schematisch de N-flux die voorkomt bij de afbraak van aminozuren. Wat gebeurt er met de koolstof? (schriftelijk)

- Bespreek (allemaal mondeling):

• tripeptide: DIP (pH=7)
• ATP-synthetase
• Hill-coëfficiënt
• tekening van rNDP reductase

01/09/14 VM

- Glycogen Phosphate: enzymatische regulering en metabolische condities

- Wat zijn Ketone aminozuren en wanneer zijn ze van belang

- Metabolisme lever en spieren bij rust en langdurige (aerobe)inspanning. Wat is de functie van de lever?

- Bespreek:

• tripeptide: KAT
• Bohr effect
• Malonyl-Coa
• nucleotide dehydrogenase afbeelding

26/06/14 NM

-hoe zou je in de praktijk en theoretisch de kinetische parameters van een inhibitor kunnen onderzoeken bij een enzymatische reactie

- c1 metabolisme en link naar nucleotide

- overzicht tekenen van spier en lever in rust en bij inspanning (aeroob), en wat is de functie van de lever

-Bespreek:

• tripeptide : RAT
• glycogeen fosforylase
• bohr effect
• tekeningske van ATP syntase

13/06/2014 VM

- Walvisvet en kameelvet zijn aanpassingen van deze dieren om te overleven in omstandigheden met een limitatie van zoet water. Verklaar.

- Coöperativiteit en allosterie zijn belangrijk in de werking van hemoglobine bij zuurstoftransport. Licht toe en leg uit. (bijvraag: Hill coëfficiënt)

- Leg uit wat ketogene aminozuren zijn en hoe ze van fysiologisch belang (bij de mens) kunnen zijn. 

- Bespreek

• KAT (tripeptide, bij pH=7)
• kinesine
• tekening van collageen
• thymidylate synthase

Datum onbekend

-Leg de werking van een enzyme uit adhv de transitietoestand. bijvraag: abzymen

-Bespreek de regulatie van de vetzuursynthese

-Bespreek:

• grafiek van competitieve inhibitie

• ribulose 5 fosfaat

• glutamaat dehydrogenase

• secundair actief transport